Les X-men se réveillent et découvrent qu'il n'y a plus aucun humain sur la planète. De monsieur Tout-le-monde aux Avengers en passant par les Fantastiques, tous les homo sapiens ont disparu. Les mutants vont s'unir afin d'élucider ce mysstère et ramener les humains sur Terre. Mais désirent-ils tous leur retour?